港鐵公司還提供其他顧問服務，範圍包括鐵路策劃、施工項目管理、建造、營運、維修、資產更新、物業發展和其他非車費收入的顧問服務。 1993年起，港鐵公司的員工會利用公餘時間貢獻社會，自發舉辦及參與義工活動。 港鐵公司於「鐵路人‧鐵路心（页面存档备份，存于互联网档案馆）」義工計劃中共參與86個社區項目，參與義工達1,800人而受助者則有12,000人。 計劃的服務對象包括長者、低收入家庭、身體殘障人士、智障人士及其他有需要人士。 於2009年3月，深圳龍華綫整個項目已獲國家發展和改革委員會批准，相關公用設施遷移及收地工作已經開始，前期準備工作已接近完成，主要土木工程可隨即展開。
自此，免觸碰的八達通卡在香港大行其道，截至2020年12月31日，在香港採用八達通的商戶逾31000家。 八達通卡及其他儲值八達通產品的流通量達3410萬張，而每日平均交易量及交易金額分別為1160萬宗及1.937億港元。。 八達通卡不僅獲各類公共交通工具廣泛接受，同時亦獲若干大型連鎖便利店及超級市場以及快餐店廣泛接受，而且透過便攜式八達通處理器，將業務擴展至中小型零售市場，吸納更多零售商戶採用八達通。 港鐵副行政總裁梁國權接受訪問就曾指出，計劃以香港的鐵路加物業模式進軍內地，除了北京、深圳及杭州之外，亦會在其他一綫城市物色拓展機會，將海外淨資產比例由現時的10%提升至15%。 不過近年亦有民間批評指港鐵發展的物業設計完全以豪宅定位，並採用巨型平台及屏風樓設計。 基座均設豪華大型會所、園藝平台及巨型入口大堂，使項目發水比例較一般住宅樓宇為高。
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港鐵在大部份日子提供每日約19小時的服務，其中東鐵綫及屯馬綫為19.5小時，大約由香港時間上午5時28分至翌日凌晨1時30分（若適逢大節日，則會通宵服務）。 於早上繁忙時間，港島綫的列車班次最短可達120秒一班，載客量最多的港鐵伊藤忠近畿川崎列車，每小時載客量可達120,000人次。 港鐵列車數目由地下鐵路公司成立時的140卡車廂，增加至1863卡。 2013年11月13日，港鐵將開辦往來斯德哥爾摩與哥德堡的新高鐵列車服務。 該鐵路綫全長455公里，名為MTR Express，由公司全資附屬公司MTR Nordic負責營運，每星期提供110班列車班次。
2013年將軍澳綫高壓電纜事故更突顯港鐵事故處理能力差劣，無論在交通安排，資訊發佈上都不能令人满意。 例如當時港鐵職員派發的「乘車應變錦囊」小冊子列出已取消的過海隧巴692線。 又如2014年9月3日，鑽石山站路軌出現裂縫事例亦說明港鐵誤導乘客，稱服務只會延誤五分鐘。
港鐵職員: 港鐵公司
而為中國及國際市場引進鐵路發展和物業管理專業知識，亦是港鐵公司持續增長策略的核心元素。 港鐵公司繼續投資中國大陸的城市鐵路網絡，以及在歐洲私有化或對外開放的市場中，尋求毋需投放大量資金的鐵路營運專營權，以實現公司的海外拓展策略，港鐵公司在4個國家，營運鐵路綫總長度2,183公里，2020年鐵路業務總載客量13.8億人次。 現時，港鐵公司擁有主要為商場及寫字樓的投資物業組合不斷增加。
- 港鐵開業至今多年，系統嚴重老化（以東鐵綫為甚），同時港鐵公司為求利潤最大化，將保養工序外判節省成本，維修檢查質素每下愈況。
- 長途列車方面，往北京西的長人二等車廂車費為1,204元，較當年通車便宜33元；商務車費則為3,768元，便宜100元。
- 不過由於寬免面積不納入發水上限一成內，因此將來發展的住宅物業只需縮減露台、會所及大堂設施面積即可達標，對於高度及體積，影響不大。
- 根據是項《特許經營協議》，港鐵公司負責投資及建設龍華綫二期，並需負責龍華綫所有運營、維修及資產管理等方面的開支，而深圳市政府會提供適當財務支持，並營運全綫30年。
- 2005年獲中國質量協會的「2005全國質量管理獎」及美國國家安全局與埃克森美孚公司聯合頒發的「拓拔‧金寶—優秀安全健康及環境管理國際大獎」（Robert W. Campbell Award）銀獎。
- 港鐵近年在鐵路，物業和其他業務都以以利益最大化，管理層聲稱要顧存股東利益，但香港政府實際才是港鐵的最大股東；另外，港鐵近年全力開拓非車務收入和非本地業務，同時又壓縮成本，犧牲了維修的人力物力投放，間接影響列車的安全可靠性和服務質素。
- 同時，港鐵公司在香港交易所中的總市值超過1,500億港元，成為總市值最大的基建類公司。
港鐵公司透過與發展商按協定比例攤分銷售或租賃物業的利潤（經扣除發展成本）、攤分實物資產或透過發展商支付的預付款項從物業發展中獲得利益。 現時，港鐵公司除營運鐵路外，亦從事多元業務，透過利用其鐵路資產及專業技術拓展至其他業務領域（包括出租列車與車站廣告媒體、車站內的零售商舖），並透過在港鐵公司鐵路範圍內可使用個人電訊網絡服務設施獲得收入。 港鐵公司還有鐵路相關顧問服務，集團亦不時從其他乘客服務獲取收益，例如出售港鐵紀念車票。
港鐵職員: 巴士服務
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亦有居民表示，港鐵開展挖掘工程後單位經常震動，屋內有牆身和地板出現裂痕。 雖然港鐵曾派員檢查，但事後認為符合安全標準，又認為裂痕是楼宇本身老舊所致，並無證據顯示與工程有關，因此拒絕負責。 而當居民從媒體得知港鐵疑與公證行「打龍通」後，他質疑港鐵當日說謊，要求對方正視工程影響及作出賠償。 2018年5月30日，蘋果日報報道紅磡站地底新建月台兩幅主要牆身，涉及2.6萬個螺絲帽接駁位近兩成螺絲頭破損或移位，不能與月台層的鋼筋接駁扭緊，而負責承建商禮頓不但未有更換問題部件，反偽裝成功接駁，安排工人將鋼筋剪短。
港鐵職員: 港鐵車站藝術
特許經營公司負責就瀋陽地鐵一、二號綫進行為期30年特許經營的營運及維修，包括運營前準備工作、列車及車站運作及維修等，並收取特許經營費用。 此外，瀋陽市政府亦與港鐵公司簽署另一份有關探討瀋陽市地鐵沿線及站點周邊房地產的合作開發協議，當中包括位處「金廊」的物業發展項目。 與此同時，瀋陽市政府與港鐵公司已成立聯合工作小組，現正探討未來瀋陽地鐵四號綫及二號綫北延的發展。 港鐵職員 修正早期系統觀塘綫於1979年10月1日正式投入服務，市區鐵路網絡隨即迅速發展。 一年後，首條連接香港的港島及九龍的鐵路綫亦投入服務，為香港當時的交通服務帶來重大的改變。 1989年，東區海底隧道竣工，觀塘綫伸延至香港島，成為第二條過海鐵路。
其後港鐵更在去年工程尾段終止中科餘下工程，涉及金額約7,000萬元。 面對社會各界指摘，港鐵在2018年6月27日於多份報章刊登聲明強調工程符合質量安全，「確定有關工程符合相關規格，已批准的圖則及法定要求」。 並稱「只不斷提出單方面的指控或揣測對事件毫無幫助，亦不必要地影響公眾對鐵路基建的信心。」惟聲明未有正面回應，會否鑿開月台層石屎抽驗鋼筋。 運輸系統節省14,258兆瓦時電力；並回收所有廢棄金屬及廢油；於金鐘站新建水冷塔，但仍保持耗水量較預算低3%。
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港鐵公司擁有的投資物業主要為商場及寫字樓，並管理旗下物業及其他業主的物業（除前九鐵銀禧花園及文禮閣以實益擁有權出讓方式發展，其餘均以發展權出讓方式發展）。 港鐵公司的投資物業組合包括12個商場及國際金融中心二期18層寫字樓。 另外，港鐵公司未來將會發展其他新支綫，以便應付香港長遠的發展，當中包括南港島綫（西段）、北環綫及北港島綫等。 港鐵公司亦有意參與探討港深機場聯絡綫（香港段）及啟德環保運輸系統項目的興建及營運。 港鐵公司無權就新界西北的鐵路服務範圍以外的接駁巴士服務收取車費。
港鐵高層在6月6日再召開記者會，表示在5次巡查發現鋼筋有問題，其中2015年12月發現有5條鋼筋被剪短，但另外4次沒有完整紀錄，只提到「少於5支」。 港鐵行政總裁梁國權6月7日出席電台節目時稱，按港鐵監督人員的匯報和書面紀錄，「推算」被剪短的鋼筋少於20多支。 港鐵再在6月15日公開紅磡站報告，將問題鋼筋由不多少20多支收窄至不多於17支。 港铁主导香港高铁建设，但在工作中出现了严重问题，造成了大量的超支和严重的延误，引发了香港社会的广泛不满，政府亦成立专门独立调查委员会调查该事件内情，委员会在调查报告中指出了港铁内部管理等方面存在的严重缺陷。
港鐵職員: 工程主管內部評核試疑大規模作弊
港鐵指由鑽石山去黃大仙站的行車時間增加5分鐘，其後才公佈觀塘綫由調景嶺至油麻地行車時間增加15至20分鐘，但實際乘客延誤時間遠超半小時。 港鐵開業至今多年，系統嚴重老化（以東鐵綫為甚），同時港鐵公司為求利潤最大化，將保養工序外判節省成本，維修檢查質素每下愈況。 無論列車，訊號系統及路軌結構等，都經常出現嚴重問題，最終列車班次出現嚴重延誤，甚至發生持續數個小時的局部癱瘓。 2018年3月中，《東方日報》揭發紅磡世界殯儀館對出的隧道自2017年8月已出現滲水問題，工程人員用近半年時間作補救措施，但成效欠佳。 港鐵到2018年2月發現隧道的接駁工程出問題，需鑿開其中一個駁口石屎表面調查，發現內部的鋼筋疑未有完全接駁好和未有灌滿石屎。 其後重新施工，需臨時拆除一段長約10米的路軌和三處有同類問題的石屎，並重造駁口。
合營公司將負責北京四號綫的機電鐵路系統及列車，並獲得特許經營權經營該鐵路30年。 北京京港地鐵有限公司亦於2008年11月27日與北京市政府全資擁有的北京軌道交通大興綫投資有限責任公司，就全長22公里的北京地鐵大興綫的營運及維修項目簽署了諒解備忘錄。 港鐵職員 由於大興綫為四號綫的伸延，合營公司於大興綫落成後可營運大興綫直至特許經營完結。
港鐵職員: 港鐵招募
運輸及物流局局長林世雄亦稱，中港通關在即，各部門都密鑼緊鼓，希望在最短時間做好準備，運輸方面亦會做演練。 警方經調查後鎖定疑犯，派員放蛇假扮事主與疑犯交涉，其間疑犯提出見面及作出不道德行為。 昨晚喬裝探員應約到長沙灣港鐵站會面，疑犯出現時遭埋伏警員拘捕。 被捕男子35歲，報稱港鐵員工，警方相信他有權限審查港鐵內所發生案件，懷疑他濫用職權獲得少女電話。 國際公共交通聯合會（英文：International Association of Public Transport），創建於1885年，總部在比利時布魯塞爾，在各大洲具有2200個會員單位分佈在85個國家。
又指禮頓同樣「一直未提交任何證據顯示全部2.6萬支鋼筋都無剪短」，港鐵反而要求公眾「相信她們」，並不公道。 2005年起，港鐵公司與香港業餘田徑總會攜手舉辦全港最大型的競步比賽「港鐵競步賽」，鼓勵市民多做運動。 近年有業主透露因來年開支增加，要增管理費9%至18%不等。 港鐵職員 葵芳新葵芳花園業主質疑，港鐵管理樓宇時涉不必要開支，例如每年更換垃圾桶、更換防煙門。 由於經理人酬金與屋苑管理支出掛鈎，結果港鐵所享酬金亦水漲船高，屋苑儲備至年底只剩84萬。
港鐵職員: 營運深圳地鐵評價不佳
他又指，港鐵待遇並不算吸引，部份新人甚至未完成培訓，入職未夠三個月便離開。 歡迎遞交網上申請，或將履歷(註明申請之職位及編號)電郵至或郵寄至香港郵政總局信箱9916號港鐵公司人力資源管理部收。 一名35歲港鐵男職員涉嫌假扮警員，致電兩名牽涉港鐵案件的女事主，稱可就案件提供協助。 兩名女事主分別15及16歲，男職員稱需要拍攝裸露片段作調查。 港鐵職員 案件交由西區警區重案組調查，警方以涉嫌假冒公職人員及製作兒童色情物品拘捕該名男子。
港鐵職員: 港鐵發布1月車費表 往深圳北、廣州南便宜2至7元
港鐵發言人表示，由於案件仍在調查階段，目前不適宜作任何評論，港鐵會配合警方調查。 港鐵發言人指，相關員工已被暫停職務，港鐵會按內部既定程序處理個案，港鐵對於員工操守行為有嚴格要求，若有員工做出任何有違操守行為，公司會嚴肅處理。 2008年獲最佳業務管理集團頒發「最佳業務實踐獎（培訓及人力發展組別）」殊榮，及獲賽門鐵客大中華頒發「2008創新大獎」。 2005年獲中國質量協會的「2005全國質量管理獎」及美國國家安全局與埃克森美孚公司聯合頒發的「拓拔‧金寶—優秀安全健康及環境管理國際大獎」（Robert W. Campbell Award）銀獎。 5名在2017年港鐵縱火案中受傷的市民向港鐵及保險公司索償無果，有傷者需住院半年，手腳等身體多處造成殘障，又失去工作能力，更指港鐵「除送上水果籃外便再無下文」，更有指第三者責任保險不會為索償的傷者賠償一分一毫。
港鐵職員: 港鐵男職員涉冒警 要求兩少女拍裸露影片被捕
較知名的香港物業業務包括：君臨天下、凱旋門、日出康城等住宅項目，及圓方、國際金融中心一、二期／國際金融中心商場、環球貿易廣場（已連同管理權售予合作發展商新鴻基地產）等商業項目。 截至2011年12月31日，港鐵公司管理住宅單位數目86,162個單位和管理商用及寫字樓面積744,725平方米。 2007年，地鐵公司錄得151億港元盈利，比1997年的2.78億港元為高。 中國大陸為港鐵公司業務發展策略的重點，主要集中在城市鐵路的開發及投資，並為中國大陸提供鐵路營運、物業管理及顧問服務。 目前，北京港鐵4號綫、14號綫項目進展暢順，港鐵公司亦為深圳市軌道交通四號綫項目獲得審批作好準備，並繼續在杭州、蘇州、天津及武漢等主要城市以及北京及深圳尋找更多類似投資項目機會。 截至2008年底，港鐵公司為中國、亞洲、澳洲、中東以及歐洲的鐵路項目提供鐵路定綫和訊號系統等的顧問服務。
儘管港鐵公司持有八達通控股有限公司57.4%已發行股份，但本公司於八達通控股有限公司董事局會議的投票權以49%為限，而概無八達通控股有限公司的股東可能夠單方面控制八達通控股有限公司的董事局。 而於兩鐵合併後，港鐵公司和九廣鐵路公司持有的股份則維持不變。 東鐵線自100年以來均以路面行駛，隨人口上升，越來越多居民住在鐵路旁邊。 港鐵被批評過度軟弱，縱容居民到鐵路作隨便限制，令悉乘客乘車時間拉長5-10分鐘，同時減少載客達7,500人。 當港鐵決定推出旗下項目，會公開邀請財團交意向書，及後港鐵會向有意參加的發展商，發出招標文件，包括上蓋物業建築物位置、佈局、規劃資料、初步補地價和詳細發展限制等條款。 由於招標文件不公開，因此吸引不少發展商蜂擁提交意向書，是為取得文件了解內容。
港鐵職員: 港鐵疑串通公證行 阻撓居民申索
陳表示，普通的列車車長，頂薪近兩萬元；若晉升至列車員工主任及經理，月薪可高達4萬至7萬元。 翻查資料，高鐵車票分為公布票價及執行票價，前者為原價，後者則為發售價，車票以人民幣定價，港元票價根據匯率而每月調整，並於每月首日公布。 與2018年9月通車時的票價相比，短途列車二等車廂票價便宜2至7元，例如往廣州南站的成人票價，最新車費為270元，較當時便宜7元；部份長途列車的價錢更便宜愈十多元，往北京西的二等車廂索價1,204元，較當年平33元。 2009年港鐵公司在道瓊斯可持續發展環球指數（DJSI World）最新公布的排名中，繼續在環球「交通及旅遊」組別名列首位；港鐵公司同時繼續被納入道瓊斯可持續發展亞太指數（DJSIAsia／Pacific）。 2009年港鐵公司的「臻善圈」於國際品質控制比賽IETEX 2009獲獎。
港鐵指7月30日下午一名職員在車站控制室內張貼告示，但指該告示對象是同站職員而非乘客，告示也非張貼在站内公眾地方。 2018年6月，立法會鐵路事宜小組委員會主席田北辰表示，收到消息，會展站的承建商在挖掘工程中，未有按程序放置足夠的橫向支撐，被港鐵發現並勒令停工，現未知工程狀況如何。 港鐵5月31日首次公開回應事件的新聞稿中，沒有交代被剪鋼筋的數量。 工程總監黃唯銘6月1日出席立法會會議時，終承認在2015年8月已發現鋼筋被剪痕跡，且總共發現5條鋼筋被人剪短，不過仍沒有交代有否其他地方出事。
港鐵職員: 香港鐵路業務
「2006年度可持續發展報告」更奪得2007年「最佳可持續發展報告獎」亞軍。 「2007年度可持續發展報告」並奪得2008年「最佳互聯網傳訊獎」優異獎。 港鐵作為八達通控股有限公司大股東，於2010年中被質疑出售八達通持卡人資料至第三方作商業用途。 同年六月有市民發現八達通卡的「個人資料聲明」中，列明該公司在卡主不反對下可把卡主個人資料用作推廣及直銷用途。 八達通行政總裁前陳碧鏵當時強調，八達通公司並沒有向任何機構出售客戶個人資料，但有參與日日賞計劃的商戶信諾環球前僱員指控陳碧鏵說謊，指八達通早已將會員身份證等個人資料，轉交信諾作電話推銷保險用途。 蘋果訪問資深建築業界人士指，鐵路月台結構必須有足夠承托力，港鐵沙中綫紅磡站月台石屎層有3米厚、面積逾5,000平方米，按一立方米石屎重2.3噸計算，整個月台層自重就有34,500噸重。
港鐵職員: 公司總部
在環保及社會責任方面共獲得34個獎項，包括商界展關懷、以及於服務、廢物分類、投資者關係及可持續資產管理等範疇的獎項；並維持納入富時社會責任環球指數及道瓊斯可持續發展環球指數。 在專營權期內，MTM會提升鐵路的可靠性及安全性以及擴大網絡的容量。 港鐵公司於2009年2月入標競投愛爾蘭首都都柏林地鐵北綫（Dublin Metro North）的營運專營權。
港鐵職員: 車站商務及鐵路相關業務
儘管其經營歷史較短，但TraxComm已向若干客戶出售了逾180千兆（Gbps）的頻寬服務。 港鐵職員 這些年來，TraxComm不斷將其光纖基礎設施擴展至多個數據中心及商業樓宇。 於2007年，TraxComm已經在某些港鐵站引入Wi-Fi無綫上網。 長途列車方面，往北京西的長人二等車廂車費為1,204元，較當年通車便宜33元；商務車費則為3,768元，便宜100元。 杭州東方面，二等車廂車費為1,046元，便宜28元；商務車票則低88元，售3,263元。 陳國基今日表示，爭取最早1月8日實施首階段通關，部分已關閉多時的口岸亦將會恢復運作。
在2006年，港鐵以公共交通國際聯會（UITP）制定的政策為基礎，正式採納「地鐵公司氣候轉變政策」；目前更擔任「UITP」可持續發展委員會主席。 港鐵公司與香港的衞生署攜手合作舉辦「多行樓梯、多點健康（页面存档备份，存于互联网档案馆）」活動，推廣行樓梯為健康帶來的好處。 標貼上會顯示站內樓梯的級數，並列有行樓梯的好處，以鼓勵乘客利用樓梯代替扶手電梯或升降機上落。